当海牙认证后的文档需要修改时，处理方式会因具体情况而异。

如果修改的内容是微小且不影响文档核心信息的，例如一些拼写错误或格式调整，可能不需要重新进行整个海牙认证流程。但需要注意的是，这种微小修改也必须经过认证机构的确认和同意。

然而，如果修改的内容较为重要，涉及到文档的关键信息、主体内容或可能影响其法律效力，通常需要重新办理海牙认证。

具体的步骤如下：

评估修改内容：首先确定修改的性质和重要性，判断是否需要重新认证。

准备原始文档和修改后的文档：提供原始经过海牙认证的文档以及修改后的完整文档。

联系原认证机构：向最初进行海牙认证的机构咨询其具体的处理政策和要求。

按照要求提交材料：可能需要再次提交相关的证明文件、身份信息等。

等待新的认证：认证机构会对新的文档进行审核和认证，这个过程需要一定的时间。

例如，一份海牙认证后的商业合同，由于双方协商对其中的交货时间进行了重大调整，这种情况下就需要重新办理海牙认证。而如果只是合同中某个条款的标点符号错误进行了更正，且经过认证机构认可不影响其效力，可能无需重新认证。

需要注意的是，不同的国家和地区以及不同的认证机构对于文档修改后的处理方式可能会有所不同，因此在进行任何操作之前，务必与相关的机构进行充分的沟通和确认。